中国信息经济学会的分支机构目前包括21个专业委员会和3个工作委员会:基础理论专业委员会、智慧医疗与服务创新专业委员会、金融科技专业委员会、信息管理专业委员会、产业数字经济专业委员会、人工智能与变革管理专业委员会、互联网经济与跨境电商专业委员会、高校实践教学研究与创新专业委员会、智慧商务专业委员会、平台管理专业委员会、数字化改革专业委员会、数字产业与区域振兴专业委员会、数智决策与信息治理专业委员会、数字经济政策研究专业委员会、数智治理与交叉信息研究专业委员会、数字经济创新专业委员会、数据智能与产业创新专业委员会、产业数字化变革与创新管理专业委员会、数智技术与新生产力专业委员会、民营企业数字化转型专业委员会、数智组织与战略创新专业委员会、教育教学工作委员会、青年工作委员会和数字经济与管理案例中心工作委员会。